Tác giả cso thể tải lên Các file phụ trợ ở Bước 4 của Quá trình nộp bài. Các file phụ trợ bao gồm các tập hợp dữ liệu nghiên cứu, công cụ nghiên cứu, tài liệu nguồn hoặc các tài liệu khác có thể đưa vào phụ lục cho bài nộp nhưng được tách ra vì những tài liệu đó có những giá trị riêng. Ngoài ra, Tác giả cũng sẽ lập chỉ mục các file phụ trợ độc lập với bài nộp, cho phép các file này được đưa vào một chỉ mục lớn hơn và những người cần có thể tìm thấy loại file này.

Định dạng của file phụ trợ. Các file phụ trợ được tải lên ở định dạng gốc của file — và không có hạn chế nào — đồng thời sẽ giữ nguyên định dạng đó, trong khi đó phần còn lại của bài nộp phải tuân theo những tiêu chuẩn của tạp chí và sẽ được chuyển dạng phù hợp để xuất bản. Điều này có nghĩa là các tập hợp dữ liệu dưới dạng bảng tính hoặc trình diễn dưới dạng file flash sẽ được tải lên và giữ nguyên ở định dạng đó; tuy nhiên, điều này cũng là một thách thức đối với bạn đọc. Tác giả cần lưu ý đến điều này khi mô tả các file phụ trợ bằng cách cung cấp địa chỉ để tải các phần mềm miễn phí để đọc và xem những file phụ trợ đó.